冷凍干燥是將含水物質，預先凍結成固態，而后在真空狀態下使其中的水分從固態升華成氣態，以除去水分而保存物質的方法。冷凍真空干燥機干燥方法得到的物品，原有的化學、生物特性基本不變，易于長期保存，加水后能恢復到凍干前的形態，并且能保持其原有的生化特性，是一種優質的干燥方法。

    冷凍真空干燥機制冷劑中微量水分對制冷系統的危害更大。對冷媒，冷凍油及蒸發器、冷凝器和配管的干燥處理是極為重要的。運行中的制冷裝置，由于制冷劑和冷凍油存在水分、固體粉未、污垢等雜質，情況嚴重時會使節流結構的節流孔產生臟堵。因此在冷媒供液管前必須裝設干燥過濾器。

    在冷凍真空干燥機凍干過程中，微生物的生長和酶的作用無法進行，因此能保持原來的性狀。由于在凍結的狀態下進行干燥，因此體積幾乎不變，保持了原來的結構，不會發生濃縮現象。由于干燥在真空下進行，氧氣極少，因此一些易氧化的物質得到了保護。干燥能排除95%～99%以上的水分，使干燥后物料保持原來的化學組成和物理性質(如多孔結構、膠體性質等)。